贝勒医学院(Baylor College of Medicine)的研究人员已经测试了利用人类细胞转分化与RNA测序来促进孟德尔疾病诊断的可行性。该方法在未诊断疾病网络病例队列中产生了25.4%的总体诊断率。研究结果发表在《美国人类遗传学杂志》上。
功能性实验，如RNA测序，读取细胞中的转录组或基因表达，通常需要支持通过外显子组测序或全基因组测序获得的遗传诊断。然而，RNA测序的有效性受到临床可及组织(如血液或皮肤成纤维细胞)中疾病相关基因表达的限制，这些细胞有助于结缔组织的形成。
贝勒大学分子和人类遗传学副教授、acgme认可的实验室遗传学和基因组学奖学金项目主任刘鹏飞博士说:“这在神经系统疾病中尤其有问题，因为导致疾病的基因可能不会在血液和皮肤细胞中表达。”
为了克服这一挑战，由第一作者、贝勒大学刘博士实验室的工作人员李胜兰博士领导的研究人员，通过一种称为转分化的过程，将皮肤活检中获得的成纤维细胞转化为神经元。“这种方法激活神经元特异性基因表达，增加了我们准确描述这些细胞中致病突变的可能性，”李说。
为了临床验证，研究人员在未诊断疾病网络中为71名具有神经表型的个体生成了这些诱导神经元。诱导神经元的RNA测序导致18人(25.4%)的诊断;其中5例无法仅通过成纤维细胞的RNA测序进行诊断。
刘说:“这项研究表明，成纤维细胞到神经元的转分化随后的RNA测序是一种简单，低成本和可重复的方法，具有合理的周转时间，使其在临床实施上可行。”“这种新的测试方法代表了实验室遗传学的范式转变，从传统的以dna为中心的方法转向了专注于患者细胞的方法。”
“这是令人兴奋的应用这项完善的技术，以前已被用于研究神经退行性疾病的机制，在遗传诊断的新用途，”李说。
更多信息:李胜兰等，RNA测序后人类受体细胞转分化的临床应用和诊断实施，《美国人类遗传学杂志》(2024)。DOI: 10.1016/ j.j ajh .2024.03.007期刊信息:美国人类遗传学杂志由贝勒医学院提供引文:用RNA测序进行转分化有助于遗传疾病的诊断(2024,4月9日)检索自2024年4月9日https://medicalxpress.com/news/2024-04-transdifferentiation-rna-sequencing-aids-diagnosis.html此文档受版权保护。除为私人学习或研究目的而进行的任何公平交易外，未经书面许可，不得转载任何部分。内容仅供参考之用。
